Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DspE9Q557 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms