Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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