Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms