Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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