Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddx60E9PZQ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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