Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gcom1E9PZ54 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gcom1E9PZ54 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms