Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph10bE9PYQ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms