Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3298E9PW80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms