Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4884E9PVP9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm4884E9PVP9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms