Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc17E9PVB5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc17E9PVB5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms