Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syde2E9PUP1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syde2E9PUP1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms