Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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BC035044E0CXF8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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