Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms