Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc8D3YZV8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms