Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms