Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc170D3YXL0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms