Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm4950D3YUM8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4950D3YUM8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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