Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm17333C6EQI3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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