Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CatipB9EKE5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CatipB9EKE5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms