Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Clip3B9EHT4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clip3B9EHT4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms