Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Siah3B2RWG3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms