Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AU015836B2RUM3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AU015836B2RUM3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms