Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zscan5bB2RTN3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms