Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms