Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ythdc2B2RR83 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ythdc2B2RR83 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms