Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Plekhd1B2RPU2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms