Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brpf3B2KF05 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brpf3B2KF05 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms