Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trabd2bB1ATG9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trabd2bB1ATG9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trabd2bB1ATG9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trabd2bB1ATG9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trabd2bB1ATG9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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