Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik3B1AS29 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms