Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slfn8B1ARD8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms