Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp4A4UUI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp4A4UUI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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