Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Odf2A3KGV1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms