Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Palm3A2TJV2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Palm3A2TJV2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms