Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn3aA2ASI5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms