Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga8A2ARA8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga8A2ARA8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms