Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CerklA2AQH1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms