Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AI481877A2ALV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AI481877A2ALV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms