Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lcn6A2AJB9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lcn6A2AJB9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms