Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdccag3A2AIW0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdccag3A2AIW0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms