Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm16A2A935 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm16A2A935 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms