Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm2A2A7B5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms