Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd2l1A2A259 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms