Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1bA1Z198 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1bA1Z198 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms