Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc173A0JLY1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms