Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSK3

Lnp1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnp1A0A1B0GSK3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnp1A0A1B0GSK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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