Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms