Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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