Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv31A0A075B5J5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv31A0A075B5J5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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