Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5538W4VSP6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5538W4VSP6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms