Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm4T1NXB5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm4T1NXB5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms